外商投資企業外資股權轉讓（以下簡稱“外資股權轉讓）所得稅在性質上屬于預提所得稅。
　　《中華人民共和國外商投資企業和外國企業所得稅法》(以下簡稱“《外資所得稅法》”)有間接性的規定：“外國企業在中國境內未設立機構、場所，而有取得的來源于中國境內的利潤、利息、租金、特許權使用費和其他所得，或者雖設立機構、場所，但上述所得與其機構、場所沒有實際聯系的，都應當繳納百分之二十的所得稅。”邏輯上講，其中的“其他所得”應該包括外資股權轉讓所得。
　　財政部1987年發布的【財稅外字】［1987］033號《財政部稅務總局關于對外商投資企業征收所得稅若干政策業務問題的通知》對外資股權轉讓所得稅問題作出了明確規定：“九、關于中外合資經營企業的外國合營者，外資企業的出資者轉讓股權所得的征稅問題。股權轉讓所得是指合營企業的外國合營者、外資企業的出資者轉讓其在企業所有的股權而獲取的超出其出資額部分的轉讓收益，應按規定征收20%預提所得稅。”
　　關于預提所得稅的稅率問題，我國《外資所得稅法》規定為20%。2000年11月18日國發［2000］37號《國務院關于外國企業來源于我國境內的利息等所得減征所得稅問題的通知》規定：“自2000年1月1日起，對在我國境內沒有設立機構、場所的外國企業，其從我國取得的利息、租金、特許權使用費和其他所得，或者雖設有機構、場所，但上述各項所得與其機構、場所沒有實際聯系的，減按10%稅率征收企業所得稅。”
　　從上述幾個文件可以看出，在執行《新所得稅法》前，我國外資股權轉讓應繳納預提所得稅，稅率為10%。
　　《新所得稅法》規定，非居民企業在中國境內未設立機構場所的，或者雖設立機構、場所但取得的所得與其所設機構場所沒有實際聯系的，應當就其來源于中國境內的所得繳納企業所得稅，適用稅率為20%。可見執行《新所得稅法》后，外資股權轉讓所得仍需繳納所得稅，稅率將由現行的10%調整為20%。
　　
外資股權轉讓所得稅的計算
　　
　　我國關于股權轉讓所得稅問題的解釋散見于不同時期的多個法規中，而且解釋都不盡相同，并且其中只有部分適用于外資股權轉讓所得稅，因此，實務人員需要系統了解這些法規并且判斷其適用性，才能準確地計算出外資股權轉讓應繳納的所得稅。
　　財政部［1987］033號文規定：“股權轉讓所得是指合營企業的外國合營者、外資企業的出資者轉讓其在企業所有的股權而獲取的超出其出資額部分的轉讓收益，應按規定征收20%預提所得稅”。這里，股權轉讓所得是轉讓價格與出資額之間的差額。轉讓價格一般理解為收購雙方確定的轉讓價格，出資額應理解為等值人民幣金額。
　　國稅發［1997］71號《關于外商投資企業合并、分立、股權重組等業務所得稅處理的暫行規定》對計稅轉讓收益的解釋重新作了解釋：“股權轉讓收益或損失是指股權轉讓價減除成本價后的差額。股權轉讓價是指股權轉讓人就轉讓的股權所收取的包括現金、非貨幣資產或者權益等形式的金額；如被持股企業有未分配利潤或稅后提存的各項基金等股東留存收益的，股權轉讓人隨轉讓股權一并轉讓該股東留存收益權的金額(以不超過被持股企業賬面的分屬為股權轉讓人的實有金額為限)，屬于該股權轉讓人的投資收益額，不計為股權轉讓價。股權成本是指股東(投資者)投資入股時向企業實際交付的出資金額，或收購該項股權時向該股權的原轉讓人實際支付的股權轉讓金額。”即計稅轉讓價格中不包括被持股企業的未分配利潤及稅后提存的各項基金等股東留存收益。
　　從國稅發［1997］71號文的規定可以看出，外方股東享有的外商投資企業盈余公積和未分配利潤等留存收益項目不計為股權轉讓價，但該文并沒有明確外方股東享有的資本公積份額以及享有的實收資本份額與出資額之間的差額在計算股權轉讓所得稅時應如何處理。外商投資企業資本公積形成的原因比較多，其中外資股東超資本金投資所形成的資本公積包括在71號文的“股權成本”中，而企業資產重組和債務重組等原因形成的資本公積在71號文中沒有涉及。71號文的精神主要是避免雙重征稅，企業債務重組形成的收益已由企業繳納了所得稅，債務重組形成的資本公積部分不應計為股權轉讓價，但股權轉讓人享有的資產重組中形成的資本公積份額本質上屬于資本利得，不屬于投資收益。因此，在資產重組時不需要繳納所得稅，但在股權轉讓時該收益已經變現，按71號文的規定應計入股權轉讓價。
　　需要注意的是，71號文轉讓成本中“收購該項股權時向該股權的原轉讓人實際支付的股權轉讓金額”有一個前提條件：只有收購股權時已經繳納過預提所得稅后，向該股權的原轉讓人實際支付的股權轉讓金額才可以計為計稅轉讓成本，否則，只能以原轉讓人的出資成本作為計稅轉讓成本。
　　基于與國稅發［1997］71號文同樣的避免雙重征稅原則，國稅發〔1998〕97號《企業改制中若干所得稅業務問題的暫行規定》明確規定，計算企業轉讓股權所得稅的轉讓收益也可以扣除盈余公積和未分配利潤等項目，但國稅發[2000]118號《國家稅務總局關于企業股權投資業務若干所得稅問題的通知(一)》否定了這一原則，要求：“企業股權轉讓所得或損失是指企業因收回、轉讓或清算處置股權投資的收入減除股權投資成本后的余額。企業股權投資轉讓所得應并入企業的應納稅所得，依法繳納企業所得稅”。國稅函[2004]390號《國家稅務總局關于企業股權轉讓有關所得稅問題的補充通知》規定：“股權轉讓人應分享的被投資方累計未分配利潤或累計盈余公積應確認為股權轉讓所得，不得確認為股息性質的所得”。
　　按照我國稅收法規適用性規則，財政部〔1998〕97號文、國稅發[2000]118號文及國稅函[2004]390號文都只適用于內資企業，不適用于外商投資企業。因此，國稅發［1997］71號文目前仍是關于外資股權轉讓的最新規定，即，外商投資企業的外方股東轉讓其股權時，計稅轉讓收益中可以扣除股權轉讓人享有的盈余公積和未分配利潤等留存收益項目，但中方股東轉讓其股權則不能扣除。
　　《新所得稅法》規定，非居民企業的轉讓財產所得，以收入全額減除財產凈值后的余額為應納稅所得額，其中“收入全額”和“財產凈值”的具體含義并不是清晰可見，需要在《新所得稅法》的實施細則中加以明確。按字面含義理解，收入全額應該是指股權轉讓人就轉讓的股權所收取的包括現金、非貨幣資產或者權益等形式的金額，財產凈值是指財產的賬面凈值，具體到外商投資企業的外資股權的財產凈值應指外資股東應享有的外商投資企業凈資產的賬面凈值。但考慮到外商投資企業經常有資產重組等行為，由此導致外資股東享有的外商投資企業凈資產的變化屬于資本利得，在資產重組時形成，在股權轉讓時實現。從所得稅稅收法理上看，此類資本利得應在外資股權轉讓時計入應納稅所得額。為避免稅款計算遺漏，建議將外資股權轉讓中的“財產凈值”解釋為外資股東投入到外商投資企業的資本和應享有外商投資企業盈余公積和未分配利潤的數額。

外資股權轉讓所得稅的繳納方式
　　
　　外資股權轉讓所得稅在性質上屬于預提所得稅，稅款應由買方代扣代繳。我國《外資所得稅法》第十九條規定：“……依照前款規定繳納的所得稅，以實際受益人為納稅義務人，以支付人為扣繳義務人。稅款由支付人在每次支付的款額中扣繳。扣繳義務人每次所扣的稅款，應當于五日內繳入國庫，并向當地稅務機關報送扣繳所得稅報告表。”
　　國家稅務總局1998年5月29日發布的《國家稅務總局關于加強外國企業預提所得稅代扣代繳管理工作的通知》(國稅發〔1998〕85號)規定：“三、扣繳義務人同外國企業簽訂信貸、租賃、技術轉讓、股權轉讓、擔保等合同或協議后，應將所簽訂的上述合同報主管稅務部門；同時應嚴格按照稅法的規定履行扣繳義務。”
　　《新所得稅法》規定，“對非居民企業取得本法第三條第三款規定的所得應繳納的所得稅，實行源泉扣繳，以支付人為扣繳義務人。稅款由扣繳義務人在每次支付或者到期應支付時，從支付或者到期應支付的款項中扣除。”
　　可以看出，上述法規對外資股權轉讓稅收主管部門的規定是不太明確的，《外資所得稅法》只是籠統地提及“當地稅務機關”，一般理解是指扣繳義務人的當地稅務機關。但當外資股權轉讓雙方都是境外企業時，作為扣繳義務人的境外買方在我國沒有主管稅務部門，此時境外買方應向哪一個稅務機關申報繳納所得稅？
　　從稅收法理看，稅源一般應在形成地就地繳納。從稅務征管的可行性看， 稅務機關是通過外商投資企業稅務變更登記環節對外資股權轉讓所得稅進行監控。當外商投資企業股權發生變化時，稅務部門要求企業在股權變化后一個月內做稅務變更登記。辦理稅務變更登記業務，企業需出具股權轉讓完稅證明。因此建議將外資股權轉讓所得稅的主管稅務機關明確為外商投資企業的當地主管稅務機關。我國的外商投資企業有責任提醒并督促股權購買方，尤其是境外的購買方，及時申報繳納應代扣的外資股權轉讓所得稅款。