與香港公司交易時，能否減免公司國內增值稅，主要取決于具體的交易性質、稅收政策以及是否滿足相關的減免稅條件。以下是對這一問題的詳細分析：

一、增值稅減免的基本原則
增值稅的減免通常遵循國家稅法及相關稅收協定的規定。在中國，增值稅的減免政策往往與鼓勵特定行業、促進跨境貿易或避免雙重征稅等目標相關。

二、與香港公司交易的增值稅處理
跨境交易性質：

如果交易涉及跨境服務或貨物銷售，需要特別注意增值稅的處理方式。跨境交易可能受到不同國家或地區的稅法管轄，因此需要了解并遵守相關的稅收規定。
稅收協定：

中國與香港特別行政區簽訂了避免雙重征稅和防止偷漏稅的協定。根據這一協定，雙方在某些情況下可以減免對方居民的增值稅。例如，根據內地和香港雙邊稅收協定，如果內地企業從香港進口貨物或服務，并符合一定條件，可以享受增值稅的減免。
具體減免稅條件：

增值稅的減免通常需要滿足特定的條件。這些條件可能包括交易的性質、交易雙方的身份、交易的金額以及是否涉及特定的稅收優惠政策等。
三、實際操作中的注意事項
了解稅收政策：

在與香港公司進行交易前，企業應充分了解相關的稅收政策，包括增值稅的減免政策、跨境交易的稅收處理規定等。
合規操作：

企業應確保交易的真實性和合規性，避免利用虛假交易或其他非法手段逃避稅收。
咨詢專業機構：

對于復雜的跨境交易或涉及大額增值稅的情況，企業應咨詢專業的稅務顧問或會計師，以確保稅務處理的準確性和合規性。
四、結論
與香港公司交易時，能否減免公司國內增值稅取決于具體的交易性質、稅收政策以及是否滿足相關的減免稅條件。企業應充分了解相關的稅收政策，確保交易的合規性，并在必要時咨詢專業機構以獲取準確的稅務處理建議。

請注意，以上信息僅供參考，具體稅務處理應以國家稅法及相關稅收協定的規定為準。